Quatre postes de data manager (H/F) à l’Institut Pasteur (Paris)

La gestion des données est devenue une priorité stratégique pour l’Institut Pasteur qui déploie des efforts pour fédérer et renforcer les capacités de gestion des données sur le campus parisien. L’Institut Pasteur recrute 4 Data Manager ( 3 CDI, 1 CDD) travaillant principalement sur les projets/unités de recherche suivantes:

• Projet -2-trial (www.aims-2-trials.eu): le consortium AIMS-2-TRIALS est un vaste consortium européen (48 partenaires, 14 pays) travaillant dans le domaine des TSA pour mieux comprendre la biologie de l’autisme afin de développer des médicaments de précision adaptés à chaque patient. Les données stockées dans la base de données sont multimodales (eye tracking, tests cognitifs, questionnaires cliniques, EEG, IRM, NIRS, génétique, etc.). Nous avons besoin d’un clinical data manager expérimenté capable de structurer un grand volume de données hétérogènes (origines géographiques, logiciels, formats, contenus).
• Projet Milieu Interieur (http://www.milieuinterieur.fr/en): Le projet Milieu Intérieur est une étude de cohorte ambitieuse visant à analyser l’impact de la génétique et de l’environnement, ainsi que leurs interactions sur le système immunitaire. Les objectifs sont d’établir une compréhension approfondie de la variation immunitaire, de définir le contrôle génétique de la variation phénotypique immunitaire et de déterminer le rôle du microbiote dans la régulation des programmes immunitaires. Le data manager traitera de grands ensembles de données biologiques (génomes humains, ARN-seq transcriptomes, microbiomes, protéomes, etc.), gérera le cycle de vie complet des données et développera des bases de données en ligne et hors ligne facilitant les demandes d’accès régulières aux données.
• 2 Essais cliniques au CRT ( Centre de recherche translationnelle ): ABCESS 2 est un essai clinique national de phase 3 comparant 2 stratégies antibiotiques chez des patients atteints d’hidradénite suppurée et CATH-GE, un essai clinique évaluant la sécurité et l’efficacité d’un traitement par verrou antibiotique pour cathéter infecté. Le data manager sera responsable (mais sans s’y limiter) de la gestion des données cliniques collectées via l’application REDCap, du nettoyage et analyses de contrôles de cohérence (avec Stata ou SAS) et de la conservation des données en étroite relation avec les chefs de projets et les investigateurs principaux. Une expérience préalable dans des essais cliniques académiques sera fortement appréciée.
• Unité de médecine d’anthropologie et d’écologie des maladies émergentes: Il s’agit de gérer des données sociales, écologiques, géographiques et quantitatives, du nettoyage des bases de données qualitatives et quantitatives, des analyses statistiques initiales des preuves quantitatives et géographiques. Le data manager recruté doit avoir des compétences et une expérience dans le domaine de l’anthropologie.

TÂCHES ET RESPONSABILITÉS

L’objectif principal est de fournir un appui aux unités et plates-formes de recherche de l’Institut Pasteur pour la gestion des données de leurs projets. Ce soutien sera principalement assuré par les tâches et responsabilités suivantes :

• Planifier et anticiper les besoins de gestion des données pour une meilleure gestion des ressources tout en tenant compte des problématiques de normalisation et de sécurité,
• Créer, tester et valider les bases de données et former les utilisateurs pour garantir la saisie correcte dans la base de données,
• Mettre en œuvre des contrôles de cohérence pour valider la qualité et l’intégrité des données et des métadonnées,
• Nettoyer les données pour faciliter le travail analytique du biostatisticien et la reproductibilité des résultats,
• Assurer le stockage à long terme des données (normes, formats ouverts …) et intervenir sur le tri des données pour les conserver,
• Faciliter le partage de données avec la communauté scientifique tout en mettant en œuvre des règles pour les droits d’accès aux données et le respect des normes réglementaires, ainsi que des procédures opérationnelles standard et des principes FAIR,
• Rédiger la documentation / les guides d’utilisation et créer des ateliers et des sessions de formation pour une gestion efficace des données par les scientifiques et les équipes de recherche sur le campus parisien mais également au sein du réseau international de l’Institut Pasteur (32 instituts dans le monde),
• Mettre en place un processus facilitant la recherche, l’accessibilité, l’interopérabilité et la réutilisation des données.

PROFILS ATTENDUS

Pour postuler, vous devez:

• Détenir un diplôme en data management (clinique et / ou autre) ou un niveau de connaissances équivalent avec idéalement plus de 2 ans d’expérience professionnelle,
• Avoir de l’expérience dans des langages de programmation (exemple, SQL, Python, Perl, Java, …),
• Avoir de l’expérience avec les logiciels statistiques (R, Stata, SAS …),
• Avoir de l’expérience avec REDCap et/ou LabKey et/ou Access est un atout,
• Avoir de fortes compétences en communication,
• Être dynamique, autonome et motivé pour travailler en étroite collaboration avec des scientifiques et des équipes techniques dans un environnement interdisciplinaire,
• Maîtriser l’anglais.

Une expérience de la gestion de données dans un centre de recherche public/universitaire ou un hôpital serait un atout.

Pour POSTULER

Les candidatures en anglais ou en français (lettre de motivation, CV détaillé et adresses de référents) , via le lien suivant :
https://c3bi.pasteur.fr/jobs/data-manager-available-positions/